MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pC

Total Repeats: 21949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010997	GGC	2	6	117	122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894341
2	NC_010997	GTT	2	6	124	129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894341
3	NC_010997	TCC	2	6	130	135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894341
4	NC_010997	CTG	2	6	150	155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894341
5	NC_010997	CG	3	6	215	220	0 %	0 %	50 %	50 %	190894341
6	NC_010997	GGC	2	6	225	230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894341
7	NC_010997	CGA	2	6	257	262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894341
8	NC_010997	GCGCC	2	10	284	293	0 %	0 %	40 %	60 %	190894341
9	NC_010997	CGC	2	6	314	319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894341
10	NC_010997	GCCC	2	8	337	344	0 %	0 %	25 %	75 %	190894341
11	NC_010997	GGC	2	6	366	371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894341
12	NC_010997	CGA	2	6	410	415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894341
13	NC_010997	CAG	2	6	474	479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894341
14	NC_010997	GAT	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894341
15	NC_010997	TTG	2	6	520	525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894341
16	NC_010997	GGA	2	6	534	539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894341
17	NC_010997	CCA	2	6	575	580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894341
18	NC_010997	GC	3	6	627	632	0 %	0 %	50 %	50 %	190894341
19	NC_010997	GCG	2	6	688	693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894341
20	NC_010997	GTT	2	6	750	755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894341
21	NC_010997	TGA	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894341
22	NC_010997	AGC	2	6	805	810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894341
23	NC_010997	GCC	2	6	813	818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894341
24	NC_010997	GCT	2	6	821	826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894341
25	NC_010997	CGG	2	6	926	931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894341
26	NC_010997	TGC	2	6	960	965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894341
27	NC_010997	GCGCT	2	10	967	976	0 %	20 %	40 %	40 %	190894341
28	NC_010997	TCG	2	6	1108	1113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894341
29	NC_010997	GAT	2	6	1236	1241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894341
30	NC_010997	GGC	2	6	1242	1247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894341
31	NC_010997	CGA	2	6	1331	1336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894341
32	NC_010997	CTG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894341
33	NC_010997	GC	3	6	1380	1385	0 %	0 %	50 %	50 %	190894341
34	NC_010997	GCCT	2	8	1410	1417	0 %	25 %	25 %	50 %	190894341
35	NC_010997	AGCG	2	8	1474	1481	25 %	0 %	50 %	25 %	190894341
36	NC_010997	TTTC	2	8	1552	1559	0 %	75 %	0 %	25 %	190894341
37	NC_010997	ACC	2	6	1621	1626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894341
38	NC_010997	TGT	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894341
39	NC_010997	CCT	2	6	1685	1690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894341
40	NC_010997	CAC	2	6	1692	1697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894341
41	NC_010997	GCG	2	6	1699	1704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894341
42	NC_010997	AGG	2	6	1741	1746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894341
43	NC_010997	CGA	3	9	1760	1768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894341
44	NC_010997	CCA	2	6	1775	1780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894341
45	NC_010997	CGG	2	6	1866	1871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894342
46	NC_010997	GATCA	2	10	1891	1900	40 %	20 %	20 %	20 %	190894342
47	NC_010997	CAG	2	6	1918	1923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894342
48	NC_010997	CAT	2	6	1930	1935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894342
49	NC_010997	GGC	2	6	1936	1941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894342
50	NC_010997	GGC	2	6	1953	1958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894342
51	NC_010997	CGC	3	9	1962	1970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894342
52	NC_010997	GATC	2	8	2094	2101	25 %	25 %	25 %	25 %	190894342
53	NC_010997	TTG	2	6	2147	2152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894342
54	NC_010997	TCG	2	6	2246	2251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894342
55	NC_010997	CGC	2	6	2455	2460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894342
56	NC_010997	CTC	2	6	2464	2469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894342
57	NC_010997	GC	3	6	2478	2483	0 %	0 %	50 %	50 %	190894342
58	NC_010997	AGA	2	6	2493	2498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894342
59	NC_010997	TGCC	2	8	2533	2540	0 %	25 %	25 %	50 %	190894342
60	NC_010997	GAAG	2	8	2596	2603	50 %	0 %	50 %	0 %	190894342
61	NC_010997	TTG	2	6	2633	2638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894342
62	NC_010997	GAA	2	6	2656	2661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894342
63	NC_010997	GCG	2	6	2688	2693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894342
64	NC_010997	GCC	2	6	2753	2758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894342
65	NC_010997	GGA	2	6	3270	3275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894343
66	NC_010997	GCG	2	6	3278	3283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894343
67	NC_010997	TGA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894343
68	NC_010997	GAG	2	6	3312	3317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894343
69	NC_010997	CCT	2	6	3330	3335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894343
70	NC_010997	GGC	2	6	3338	3343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894343
71	NC_010997	TCC	2	6	3401	3406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894343
72	NC_010997	ATA	2	6	3475	3480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190894343
73	NC_010997	CG	3	6	3508	3513	0 %	0 %	50 %	50 %	190894343
74	NC_010997	CGA	3	9	3573	3581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894343
75	NC_010997	GGA	2	6	3585	3590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894343
76	NC_010997	CCGG	2	8	3624	3631	0 %	0 %	50 %	50 %	190894343
77	NC_010997	CGC	2	6	3679	3684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894343
78	NC_010997	ATGC	2	8	3971	3978	25 %	25 %	25 %	25 %	190894344
79	NC_010997	CG	3	6	4099	4104	0 %	0 %	50 %	50 %	190894344
80	NC_010997	GTC	3	9	4125	4133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894344
81	NC_010997	GCCG	2	8	4163	4170	0 %	0 %	50 %	50 %	190894344
82	NC_010997	CG	3	6	4189	4194	0 %	0 %	50 %	50 %	190894344
83	NC_010997	GGT	2	6	4289	4294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894344
84	NC_010997	CCGGC	2	10	4334	4343	0 %	0 %	40 %	60 %	190894344
85	NC_010997	CGT	2	6	4364	4369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894344
86	NC_010997	GA	3	6	4414	4419	50 %	0 %	50 %	0 %	190894344
87	NC_010997	CAG	2	6	4428	4433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894344
88	NC_010997	ATC	2	6	4440	4445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894344
89	NC_010997	TGG	2	6	4453	4458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894344
90	NC_010997	GTC	2	6	4526	4531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894344
91	NC_010997	CGA	2	6	4553	4558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894344
92	NC_010997	CG	3	6	4563	4568	0 %	0 %	50 %	50 %	190894344
93	NC_010997	CGGC	2	8	4667	4674	0 %	0 %	50 %	50 %	190894344
94	NC_010997	TCG	2	6	4753	4758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894344
95	NC_010997	TCA	2	6	4768	4773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894344
96	NC_010997	ACG	2	6	4782	4787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894344
97	NC_010997	ACA	3	9	4831	4839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894344
98	NC_010997	AAC	2	6	4848	4853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894344
99	NC_010997	GGC	2	6	4946	4951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894345
100	NC_010997	GCT	2	6	4996	5001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894345
101	NC_010997	CTG	3	9	5018	5026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894345
102	NC_010997	ACC	2	6	5066	5071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894345
103	NC_010997	ATG	2	6	5090	5095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894345
104	NC_010997	GCG	2	6	5121	5126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894345
105	NC_010997	CGT	3	9	5140	5148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894345
106	NC_010997	GAG	2	6	5255	5260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894345
107	NC_010997	GCA	2	6	5329	5334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894345
108	NC_010997	CCG	2	6	5343	5348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894345
109	NC_010997	CGG	2	6	5416	5421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894345
110	NC_010997	CGT	3	9	5437	5445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894345
111	NC_010997	GC	3	6	5468	5473	0 %	0 %	50 %	50 %	190894345
112	NC_010997	CATCGG	2	12	5503	5514	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190894345
113	NC_010997	CGA	2	6	5551	5556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894345
114	NC_010997	ACG	2	6	5604	5609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894345
115	NC_010997	GCC	4	12	5633	5644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894345
116	NC_010997	CGA	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894345
117	NC_010997	GC	4	8	5659	5666	0 %	0 %	50 %	50 %	190894345
118	NC_010997	CCG	2	6	5825	5830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894346
119	NC_010997	GCG	2	6	5832	5837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894346
120	NC_010997	CCT	2	6	5852	5857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894346
121	NC_010997	GCG	2	6	5918	5923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894346
122	NC_010997	GAGC	2	8	6033	6040	25 %	0 %	50 %	25 %	190894346
123	NC_010997	CGGG	3	12	6060	6071	0 %	0 %	75 %	25 %	190894346
124	NC_010997	AGC	4	12	6124	6135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894346
125	NC_010997	GCC	2	6	6174	6179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894346
126	NC_010997	GCC	2	6	6188	6193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894346
127	NC_010997	CTC	2	6	6207	6212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894346
128	NC_010997	CGA	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894346
129	NC_010997	TTG	2	6	6355	6360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894346
130	NC_010997	GCA	2	6	6380	6385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894346
131	NC_010997	TCG	2	6	6398	6403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894346
132	NC_010997	GAT	2	6	6405	6410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894346
133	NC_010997	CG	3	6	6440	6445	0 %	0 %	50 %	50 %	190894346
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257	NC_010997	CGA	2	6	12197	12202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894352
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261	NC_010997	GCG	2	6	12340	12345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894352
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264	NC_010997	CCG	3	9	12584	12592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894353
265	NC_010997	GCA	2	6	12624	12629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894353
266	NC_010997	CG	3	6	12774	12779	0 %	0 %	50 %	50 %	190894353
267	NC_010997	ACCG	2	8	12807	12814	25 %	0 %	25 %	50 %	190894353
268	NC_010997	CGC	2	6	12816	12821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894353
269	NC_010997	GCAG	2	8	12972	12979	25 %	0 %	50 %	25 %	190894353
270	NC_010997	GCT	2	6	12981	12986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894353
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273	NC_010997	GTG	2	6	13195	13200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894353
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276	NC_010997	GCT	2	6	13441	13446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894354
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280	NC_010997	GTC	2	6	13533	13538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894354
281	NC_010997	TCG	2	6	13547	13552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894354
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285	NC_010997	TCC	2	6	13699	13704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894354
286	NC_010997	ACC	2	6	13708	13713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894354
287	NC_010997	GCC	2	6	13717	13722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894354
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290	NC_010997	AAG	2	6	13741	13746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894354
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293	NC_010997	GC	3	6	13853	13858	0 %	0 %	50 %	50 %	190894354
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299	NC_010997	GCC	2	6	14250	14255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894355
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